Vous pouvez placer dans la barre d'outils en haut de la fenêtre du document, les contrôles de votre choix, comme dans toute application Mac OS X, . La barre d'outils par défaut contient les contrôles les plus courants. Sélectionnez Personnaliser la barre d'outils... dans le menu Présentation pour afficher un panneau contenant des contrôles que vous pouvez faire glisser sur la barre d'outils. Vous pouvez afficher et masquer la barre d'outils en cliquant sur la capsule blanche située sur le côté droit de la barre de titre.

La plupart des commandes de la barre d'outils ont une fonction analogue aux commandes des menus ou aux contrôles d'inspecteurs.

Le menu local Action est une réplique du menu contextuel, quelle que soit la sélection dans la structure.

Le menu local Sections d'OmniOutliner Professionnel est une réplique de la liste des sections du volet des utilitaires ; sélectionnez une section pour l'élever.

Le bouton Utilitaires, qui affiche et masque le volet des utilitaires, peut également être sélectionné tout en appuyant sur la touche Option pour sélectionner son emplacement dans la fenêtre du document.

Les AppleScripts qui se trouvent dans vos dossiers scripts d'OmniOutliner sont également disponibles sous forme de boutons de barre d'outils. Cliquez simplement sur le bouton de barre d'outils d'un script pour l'exécuter.